中华人民共和国东莞海关于1988年7月1日正式开关,隶属于中华人民共和国黄埔海关。1990年12月起东莞海关设立驻凤岗办事。由于东莞市的加工贸易占对外贸易的90%以上,东莞海关的主要职责是依照海关法和其它有关法律、法规,进行加工贸易及保税